Hele dagen
Vestfold, Auditorium A1-36 og Zoom
Nivedhitha Jothinarayanan skal forsvare avhandlingen sin for graden philosophiae doctor (ph.d.) ved Universitetet i Sørøst-Norge.
Hun har fulgt doktorgradsprogrammet i teknologi ved Fakultet for teknologi, naturvitenskap og maritime fag (TNM).
Alle interesserte er velkomne til å følge prøveforelsningen og disputasen.
Sammendrag
Nøyaktig, kontinuerlig overvåking (på stedet i sanntid) er nødvendig for å beskytte akvatiske økosystemer på grunn av deres kompleksitet og dynamiske natur. I ulike vannforekomster på Sørøst-Norge kan nordisk gjedde (Esox lucius) være en invasiv fiskeart og dermed forstyrre det opprinnelige miljøet og økonomien i habitatet. For å finne disse artene tidlig, bruker og utvikler forskerne toppmoderne miljø-DNA (eDNA) deteksjonsteknologier.
Den vanlige og standardiserte metoden, Polymerase Chain Reaction (PCR), er nyttig, men likevel vanskelig å bruke i små, automatiserte POC (proof of concept) mikrosystemer fordi denne metoden krever hyppige temperaturendringer under analysetesting. Følgelig ser forskerne på en enklere, raskere og nyere metode kalt Loop-mediated Isothermal Amplification (LAMP). Ved å bruke spesifikke gener kan LAMP raskt oppdage invasive arter og er egnet for sanntidstesting på stedet. Det viktige er at LAMP-reaksjonen finner sted ved en konstant temperatur på 65 grader Celsius.
Lagring og transport av materialer, som reagenser for LAMP-testene, kan imidlertid være en utfordring når testene skal utføres på stedet. Derfor hjelper den objektive A-prosessen kalt lyofilisering (frysetørking) til med å gjøre reagensene mer stabile og lettere å lagre inne i POC-brikken ved romtemperatur over en viss tidsperiode.
Et annet mål som er utforsket er ulike måter å samle inn eDNA-prøver på fra elver og innsjøer, og metoder som aktiv og passiv prøvetaking har blitt sammenlignet. FORDETECT-prototypesystemet har også blitt testet for å samle kunnskap om sanntidsovervåking. Dette systemet vil automatisk både behandler og analyserer prøver for å oppdage DNA/RNA i en væskeprøve, og det vil bidra til å gi analyseresultater på stedet.
Samlet sett har denne forskningen hatt som formål å bidra med ny kunnskap til å utvikle nye raske, mer kostnadseffektive og kontamineringsfrie metoder for tidlig å kunne oppdage skadelige invasive arter i vannforekomster for bedre beskytte det globale biologiske mangfoldet.