Finn studier Videreutdanning Søknad og opptak Studie- og emneplaner Utveksling til utlandet Praksis Vi hjelper deg med studievalget Studiestart Utdanning med lønn Livet som student Bolig og velferd Muligheter under studiene Tilrettelegging og studentstøtte Alumni Studenthistorier Barnehage, skole og høyere utdanning Friluftsliv, idrett og kroppsøving Helse og velferd Humanistiske fag Kunstnerisk utviklingsarbeid Maritim virksomhet Natur, helse og miljø Naturvitenskap Synsvitenskap Teknologi Tradisjonskunst og praktisk- estetiske fag Økonomi, ledelse og regulering Oppdragsforskning Våre ph.d.-utdanninger Ph.d.-handbok Stipendiatsiden Disputaser Doktorkreering Industriforskerskolen i komplekse systemer Nærings- og offentlig-ph.d. Demokrati, samfunnsorganisering og styring Energi, klima og miljø Fremtidens helse og velferdstjenester Oppvekst, tilhørighet og livsmestring Regional verdiskapning Lørdagsuniversitetet Forskingsdagane Forskningsforedrag på bestilling Prosjekter finansiert av Forskningsrådet Fremragende sentre EU-finansierte forsknings- og innovasjonsprosjekter Andre prosjekter Internasjonale utdanningsprosjekter Ekspertliste Publisert forskning Forskningsnytt Organisasjonskart Leiinga Styret Råd, utval og ombod Fakultet Strategi og visjon Rapportar og dokument Biblioteket Brukerveiledninger Si ifra Regelverk Beredskap og krisehandsaming Campusene Jobbe hos USN? Globalt Engasjement USN Hjelp Ansatte Toppledelse Ekspertliste Samarbeid med oss Campusene

Mine studier

  • Beklager, her gikk noe galt. Vi har problemer med favorittmarkeringer for øyeblikket.
For studenter east For ansatte east
en (English (GB))

Disputas: Nivedhitha Jothinarayanan

Nivedhitha Jothinarayanan disputerer for doktorgraden i teknologi. Avhandlingen handler om isotermisk nukleinsyreamplifikasjon for automatisert bioovervåking i akvatiske økosystemer.

21 May

Praktisk informasjon

  • Dato: 21 mai 2025
  • Tid: kl. 10.00 - 15.00
  • Sted: Vestfold, Auditorium A1-36 og Zoom
  • Last ned kalenderfil

    • Lenke til digital deltakelse (Zoom)

    Program 

    Kl 10.15-11.00 Prøveforelesning: 
    eDNA: Origin, history and applications

    Kl 12.15-15.00 Disputas: Isothermal amplification for enhanced aquatic environment monitoring using eDNA for application in automatic system.

     

    Bedømmingskomité

    • Førsteopponent: Professor Svein-Ole Mikalsen, University of the Faroe Islands  
    • Andreopponent: Seniorforsker og PhD Bjørn Spilsberg, Veterinærinstituttet
    • Administrator: Førsteamanuensis Anna Pachol, Universitetet i Sørøst-Norge

       

    Veiledere


     

     

     

     

Har du spørsmål?

Nivedhitha JothinarayananNivedhitha Jothinarayanan skal forsvare avhandlingen sin for graden philosophiae doctor (ph.d.) ved Universitetet i Sørøst-Norge.

Hun har fulgt doktorgradsprogrammet i teknologi ved Fakultet for teknologi, naturvitenskap og maritime fag (TNM).

Alle interesserte er velkomne til å følge prøveforelsningen og disputasen.

Sammendrag

Nøyaktig, kontinuerlig overvåking (på stedet i sanntid) er nødvendig for å beskytte akvatiske økosystemer på grunn av deres kompleksitet og dynamiske natur. I ulike vannforekomster på Sørøst-Norge kan nordisk gjedde (Esox lucius) være en invasiv fiskeart og dermed forstyrre det opprinnelige miljøet og økonomien i habitatet. For å finne disse artene tidlig, bruker og utvikler forskerne toppmoderne miljø-DNA (eDNA) deteksjonsteknologier.

Den vanlige og standardiserte metoden, Polymerase Chain Reaction (PCR), er nyttig, men likevel vanskelig å bruke i små, automatiserte POC (proof of concept) mikrosystemer fordi denne metoden krever hyppige temperaturendringer under analysetesting. Følgelig ser forskerne på en enklere, raskere og nyere metode kalt Loop-mediated Isothermal Amplification (LAMP). Ved å bruke spesifikke gener kan LAMP raskt oppdage invasive arter og er egnet for sanntidstesting på stedet. Det viktige er at LAMP-reaksjonen finner sted ved en konstant temperatur på 65 grader Celsius.

Lagring og transport av materialer, som reagenser for LAMP-testene, kan imidlertid være en utfordring når testene skal utføres på stedet. Derfor hjelper den objektive A-prosessen kalt lyofilisering (frysetørking) til med å gjøre reagensene mer stabile og lettere å lagre inne i POC-brikken ved romtemperatur over en viss tidsperiode.

Et annet mål som er utforsket er ulike måter å samle inn eDNA-prøver på fra elver og innsjøer, og metoder som aktiv og passiv prøvetaking har blitt sammenlignet. FORDETECT-prototypesystemet har også blitt testet for å samle kunnskap om sanntidsovervåking. Dette systemet vil automatisk både behandler og analyserer prøver for å oppdage DNA/RNA i en væskeprøve, og det vil bidra til å gi analyseresultater på stedet.

Samlet sett har denne forskningen hatt som formål å bidra med ny kunnskap til å utvikle nye raske, mer kostnadseffektive og kontamineringsfrie metoder for tidlig å kunne oppdage skadelige invasive arter i vannforekomster for bedre beskytte det globale biologiske mangfoldet.